Vznikla již v roce 1969 dle návrhů architektů Hrůzy, Navrátila a Jägera.
Ve venkovní expozici se nachází 15 000 druhů stromů a květin, čímž je ideálním místem k procházce, odpočinku, relaxaci či kochání se krásou přírody. Pro meditaci je jak stvořená Japonská zahrada s rododendrony, pivoňkami, japonskými javory. Navíc z horní části zahrady se naskýtají pěkné výhledy na Prahu.
Součástí zahrady je i vinice sv. Kláry, která je památkově chráněná – roste tu několik odrůd vína, jako je Ryzlink rýnský, Müller Thurgau, Tramín červený a další druhy. Dochoval se i viniční domek, jeden z mála svého druhu v Praze.
K botanické zahradě patří také skleník Fata Morgana, který je 130 metrů dlouhý a 17 metrů široký. K vidění jsou zde tropické rostliny členěné geograficky, ale také dle kontinentů.
Každý rok se tu koná výstava motýlů, kdy jsou nakoupeny kukly motýlů, z kterých se líhnou motýli, kteří pak poletují po skleníku.