Na návštěvníky čeká rozsáhlá, velmi různorodá sbírka kamenných památek vztahujících se k období antiky, Byzancie a středověku. Lapidárum se řadí mezi nejvýznamnější svého druhu v Chorvatsku. V lapidáriu spatříte třeba náhrobky, kamenné erby z 15. století, oltář s reliéfem zvířete, jež je součástí sarkofágu, či třeba kamenné desky. Cenná je sbírka liturgického charakteru, například oltářní desky či sloupy. Ale nejvýznamnější část muzea představuje sbírka náhrobků z období raného středověku. Tato sbírka se původně nacházela v přízemí paláce Rigo, odkud byla přenesena do muzea.
