Archeologické muzeum sídlí v krásném benátském kostele San Francisca z 16. století. Nachází se v něm nálezy od neolitu až do doby římské. Lze spatřit minojské sarkofágy, románské podlahové mozaiky, zlaté šperky z doby helénské či mramorovou sochu římského císaře Hadriána. Poutavá je i socha Diany či mramorová kašna se lvími hlavami na nádvoří. Zajímavostí kostela je, že nejprve byl mešitou, od roku 1913 v něm promítalo kino a během druhé světové války tu Němci skladovali munici.
