Původní dřevěný klášter byl ve dvanáctém století kompletně přebudován a nový kamenný komplex se stal největším augustiánským klášterem severských zemí. Roku 1536, po reformaci, připadly pozemky státu a klášter byl srovnán se zemí. Mnoho cihel bylo použito při stavbě zámku Frederiksborg. Dnes na místě můžeme vidět obrysy klášterního kostela. Archeologické nálezy jsou vystaveny v muzeu kláštera Æbelholt.
