Neodmyslitelný symbol města Heraklion představuje impozantní stavba zvaná Koules, nacházející se kolem přístavu, což v překladu z turečtiny znamená „pevnost“. Dvoupatrová budova s 26 pokoji byla kdysi hradem postaveným Benátčany ve 13. stoletím. Skladovaly se tu potraviny a vojenský materiál, než došlo ke zničení budovy zemětřesením. Ale v 16. století se ji povedlo úspěšně obnovit. V místnostech byli ubytováni kapitáni a další důstojníci, přízemí sloužilo jako skladiště. Koules posloužila v době nadvlády osmanů také jako vězení pro rebely, kteří se vzepřeli Turkům. Čekala je pak smrt ve zdejších temných chodbách.